Phân lập và phân tích in silico các đặc điểm chức năng của một biến thể bản sao terpene synthase (HbTPS6L-X1) hiện diện ở vỏ thân cây cao su Hevea brasiliensis RRIV 209

Tóm tắt

Cây cao su (Hevea brasiliensis) là loài cây duy nhất được trồng để sản xuất cao su tự nhiên. Phương pháp thu hoạch mủ cao su thông qua cạo vỏ có tác động gây tổn thương cơ học cho cây. Ngoài ra, cây cao su có thể dễ bị sâu bệnh tấn công qua vết thương ở vùng bị rạch cạo. Terpenoid là nhóm hợp chất thứ cấp có vai trò quan trọng trong tương tác giữa thực vật và môi trường, đặc biệt là trong phản ứng của cây với điều kiện stress. Sự đa dạng của terpenoid chủ yếu được quyết định bởi các enzyme thuộc họ terpene synthase (TPS). Kết quả phân tích dữ liệu RNA-seq của H. brasiliensis cho thấy có nhiều gen TPS hiện diện ở loài này nhưng chức năng của chúng vẫn chưa được nghiên cứu. Bài báo trình bày kết quả phân lập từ vỏ thân cây cao su H. brasiliensis RRIV 209 một biến thể bản sao của gen TPS (ký hiệu HbTPS6L-X1). Thông qua kết quả phân tích cây tiến hóa, sự hiện diện của các motif bảo tồn, vùng trình tự peptide tín hiệu của protein và mức độ tương đồng về cấu trúc với các sesquiterpene synthase đã được nghiên cứu, HbTPS6L-X1 được dự đoán thuộc phân họ TPS-a, định vị trong tế bào chất và xúc tác chuyển hóa FPP thành các sesquiterpene. Những đặc điểm chức năng in silico này là cơ sở để thiết kế các khảo sát thực nghiệm nhằm khẳng định chức năng in planta của HbTPS6L-X1.