Sử dụng DNA barcode trong phân tích đa dạng di truyền và nhận diện một số loài Kiwi (Actinidia spp.)

Các tác giả

  • Nguyễn Thị Mỹ Hạnh
  • Hoàng Thanh Tùng, Hoàng Đắc Khải, Nguyễn Thị Như Mai, Vũ Quốc Luận, Đỗ Mạnh Cường
  • Huỳnh Hữu Đức, Nguyễn Trường Giang
  • Hoàng Thị Như Phương
  • Bùi Văn Lệ
  • Dương Tấn Nhựt*

Từ khóa:

DNA barcode, Internal Transcript Spacer, Kiwi, matK, rbcL

Tóm tắt

Nghiên cứu được thực hiện trên 20 mẫu Kiwi thuộc chi Actinidia, trong đó có 18 mẫu được thu thập từ các nguồn nhập nội và 2 mẫu từ tự nhiên của Việt Nam. Nguồn gốc cũng như mối liên hệ di truyền giữa các mẫu thu thập được phân tích, đánh giá dựa trên các trình tự DNA trong lục lạp và nhân. Kết quả khuếch đại các trình tự này ở 20 mẫu đạt 75-95%, trong đó, các mẫu khuếch đại thành công đều có thể giải trình tự. Kết quả phân tích mối quan hệ di truyền giữa các mẫu thu thập và mẫu tham chiếu trên GenBank cho từng trình tự riêng lẽ rbcL, matK và ITS (Internal Transcript Spacer) cho thấy có sự phân nhóm di truyền giữa các mẫu thu thập và nguồn gốc di truyền của các mẫu nghiên cứu có thể từ 2 đến 3 nguồn khác nhau. Ngoài ra, khi tiến hành phân tích di truyền của 14 mẫu giống Kiwi thu thập dựa trên sự kết hợp của gen rbcL, gen matK và vùng ITS cho thấy có sự phân biệt rõ ràng thành 3 nhóm riêng biệt. Kết quả bước đầu về sử dụng chỉ thị phân tử DNA barcode với các trình tự rbcL, matK và ITS cho thấy hiệu quả nhất định trong việc xác định nguồn gốc ở mức độ loài, từ đó mở ra khả năng bảo tồn và khai thác bền vững nguồn gen các loài này.

DOI:

https://doi.org/10.31276/VJST.66(12).42-48

Chỉ số phân loại

1.6, 4.6

Tiểu sử tác giả

Nguyễn Thị Mỹ Hạnh

Viện Nghiên cứu Khoa học Tây Nguyên, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, 116 Xô Viết Nghệ Tĩnh, phường 7, TP Đà Lạt, tỉnh Lâm Đồng, Việt Nam

Học viện Khoa học và Công nghệ, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, 18 Hoàng Quốc Việt, phường Nghĩa Đô, quận Cầu Giấy, Hà Nội, Việt Nam

Trường Cao đẳng nghề Đà Lạt, 9 Yersin, phường 10, TP Đà Lạt, tỉnh Lâm Đồng, Việt Nam

Hoàng Thanh Tùng, Hoàng Đắc Khải, Nguyễn Thị Như Mai, Vũ Quốc Luận, Đỗ Mạnh Cường

Viện Nghiên cứu Khoa học Tây Nguyên, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, 116 Xô Viết Nghệ Tĩnh, phường 7, TP Đà Lạt, tỉnh Lâm Đồng, Việt Nam

Huỳnh Hữu Đức, Nguyễn Trường Giang

Trung tâm Công nghệ Sinh học TP Hồ Chí Minh, 2374 quốc lộ 1A, khu phố 2, phường Trung Mỹ Tây, quận 12, Hồ Chí Minh, Việt Nam

Hoàng Thị Như Phương

Trường Đại học Đà Lạt, 1 Phù Đổng Thiên Vương, phường 8, TP Đà Lạt, tỉnh Lâm Đồng, Việt Nam

Bùi Văn Lệ

Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia TP Hồ Chí Minh, 227 Nguyễn Văn Cừ, phường 4, quận 5, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Dương Tấn Nhựt

Viện Nghiên cứu Khoa học Tây Nguyên, Viện Hàn lâm Khoa học và Công nghệ Việt Nam, 116 Xô Viết Nghệ Tĩnh, phường 7, TP Đà Lạt, tỉnh Lâm Đồng, Việt Nam

Tải xuống

Đã xuất bản

2024-12-25

Ngày nhận bài 10/3/2022; ngày chuyển phản biện 12/3/2022; ngày nhận phản biện 5/4/2022; ngày chấp nhận đăng 9/4/2022

Cách trích dẫn

Nguyễn Thị Mỹ Hạnh, Hoàng Thanh Tùng, Hoàng Đắc Khải, Nguyễn Thị Như Mai, Vũ Quốc Luận, Đỗ Mạnh Cường, Huỳnh Hữu Đức, Nguyễn Trường Giang, Hoàng Thị Như Phương, Bùi Văn Lệ, & Dương Tấn Nhựt. (2024). Sử dụng DNA barcode trong phân tích đa dạng di truyền và nhận diện một số loài Kiwi (Actinidia spp.). Bản B của Tạp Chí Khoa học Và Công nghệ Việt Nam, 66(12). https://doi.org/10.31276/VJST.66(12).42-48

Các bài báo được đọc nhiều nhất của cùng tác giả