Ứng dụng chỉ thị phân tử Microsatellite trong truy xuất phả hệ quần đàn cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) chọn giống

Các tác giả

  • Trần Thị Phương Dung*
  • Nguyễn Hồng Lộc, Nguyễn Hoàng Thông
  • Lê Hoàng Khôi Nguyên
  • Nguyễn Văn Sáng

Từ khóa:

microsatellite, multiplex PCR, Pangasianodon hypophthalmus, truy xuất phả hệ

Tóm tắt

Nghiên cứu sử dụng bộ chỉ thị gồm 10 Microsatellite để truy xuất phả hệ quần đàn cá tra chọn giống thế hệ đầu tiên. Kết quả cho thấy: (1) Khi phân tích 50 mẫu cá tra bố mẹ G0 và 50 mẫu cá con G1 thì hiệu suất PCR đạt từ 98-100% và số lượng alen (NA) dao động từ 5-14 mỗi locus. Hệ số đa dạng di truyền (PIC) trung bình của các microsatellite trên G0 và G1 lần lượt là 0,71 và 0,67, trung bình tỷ lệ dị hợp tử quan sát (HO) và tỷ lệ dị hợp tử mong đợi (HE) trên tất cả các locus lần lượt là 0,73; 0,76 và 0,73; 0,71. Mười Microsatellite khảo sát đều ổn định và đa hình phù hợp với việc truy xuất phả hệ; (2) Sau khi sàng lọc các chỉ thị và truy xuất phả hệ trên 50 gia đình cá chọn giống cho thấy bộ chỉ thị với 9 Microsatellite (loại trừ Pahy-02) truy xuất phả hệ cao, đạt được truy xuất bố mẹ chính xác đạt 93,4%, trong đó truy xuất các gia đình con bố không có half-sib đạt 93,0% và các gia đình con bố có half-sib đạt 94,0%. Qua các kết quả cho thấy, bộ chỉ thị với 9 microsatellite có thể ứng dụng để truy xuất phả hệ trong các chương trình chọn giống trên cá tra.

DOI:

https://doi.org/10.31276/VJST.64(2).48-53

Chỉ số phân loại

4.5

Tiểu sử tác giả

Trần Thị Phương Dung*

Trường Đại học Nông Lâm TP Hồ Chí Minh, khu phố 6, phường Linh Trung, TP Thủ Đức, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Trường Đại học Sư phạm TP Hồ Chí Minh, 280 An Dương Vương, phường 4, quận 5, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Nguyễn Hồng Lộc, Nguyễn Hoàng Thông

Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II, 116 Nguyễn Đình Chiểu, phường Đa Kao, quận 1, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Lê Hoàng Khôi Nguyên

Trường Đại học Quốc tế, Đại học Quốc gia TP Hồ Chí Minh, khu phố 6, phường Linh Trung, TP Thủ Đức, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Nguyễn Văn Sáng

Viện Nghiên cứu Nuôi trồng Thủy sản II, 116 Nguyễn Đình Chiểu, phường Đa Kao, quận 1, TP Hồ Chí Minh, Việt Nam

Tải xuống

Đã xuất bản

2022-02-25

Ngày nhận bài 22/7/2021; ngày chuyển phản biện 26/7/2021; ngày nhận phản biện 26/8/2021; ngày chấp nhận đăng 6/9/2021

Cách trích dẫn

Trần Thị Phương Dung*, Nguyễn Hồng Lộc, Nguyễn Hoàng Thông, Lê Hoàng Khôi Nguyên, & Nguyễn Văn Sáng. (2022). Ứng dụng chỉ thị phân tử Microsatellite trong truy xuất phả hệ quần đàn cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) chọn giống. Bản B của Tạp Chí Khoa học Và Công nghệ Việt Nam, 64(2). https://doi.org/10.31276/VJST.64(2).48-53

Số

Lĩnh vực

Khoa học Nông nghiệp